{"id":2870,"date":"2020-07-14T17:33:36","date_gmt":"2020-07-14T16:33:36","guid":{"rendered":"http:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/?p=2870"},"modified":"2020-07-14T20:45:02","modified_gmt":"2020-07-14T19:45:02","slug":"le-fameux-r0-est-il-plus-fiable-que-le-denombrement-quotidien-des-nouveaux-cas-de-covid-19-depistes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/le-fameux-r0-est-il-plus-fiable-que-le-denombrement-quotidien-des-nouveaux-cas-de-covid-19-depistes\/","title":{"rendered":"Le fameux R0 est-il plus fiable que le d\u00e9nombrement quotidien des nouveaux cas de Covid-19 ?"},"content":{"rendered":"<p>En\u00a0\u00e9pid\u00e9miologie, le\u00a0nombre de reproduction de base\u00a0ou\u00a0R<sub>0<\/sub>\u00a0(<em>ratio<\/em>\u00a00) d&rsquo;une\u00a0infection\u00a0peut \u00eatre consid\u00e9r\u00e9 comme le nombre attendu de cas directement g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par un cas dans une population o\u00f9 tous les individus sont sensibles \u00e0 l&rsquo;infection.<\/p>\n<p>\u00ab\u00a0Le R0\u00a0[est] le nombre moyen de personnes qu\u2019une personne contagieuse peut infecter. Ce taux s\u2019applique, et se calcule \u00e0 partir d\u2019une population qui est enti\u00e8rement susceptible d\u2019\u00eatre infect\u00e9e, c\u2019est-\u00e0-dire qui n\u2019a pas encore \u00e9t\u00e9 vaccin\u00e9e ni immunis\u00e9e contre un agent infectieux.\u00a0\u00bb<\/p>\n<p>Le R0\u00a0contribue \u00e0 estimer le\u00a0temps de doublement\u00a0du nombre de victimes d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie. (source: <a href=\"https:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/Nombre_de_reproduction_de_base\">Wikip\u00e9dia<\/a>)<\/p>\n<p>Il est indispensable de comprendre comment est calcul\u00e9 le R0 auquel Emmanuel Macron vient de se r\u00e9f\u00e9rer durant son allocution du 14 Juillet. Le pr\u00e9sident a utilis\u00e9 cette donn\u00e9e comme argument en faveur d&rsquo;une possible r\u00e9\u00e9mergence de l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie.<\/p>\n<p>Or, voici les informations disponibles sur le site du <a href=\"https:\/\/solidarites-sante.gouv.fr\/soins-et-maladies\/maladies\/maladies-infectieuses\/coronavirus\/tout-savoir-sur-le-covid-19\/article\/comprendre-le-nombre-de-reproduction-r\">minist\u00e8re de la sant\u00e9 et des solidarit\u00e9s:<\/a><\/p>\n<p>Le nombre de reproduction de la COVID-19, aussi appel\u00e9 \u00ab\u00a0R effectif\u00a0\u00bb, est une estimation (sur les 7 derniers jours) du nombre moyen de personnes contamin\u00e9es par un porteur du virus. Alors que le R0 indique le nombre de reproduction initial (soit en d\u00e9but d\u2019\u00e9pid\u00e9mie) le Reff, lui, d\u00e9signe le nombre de reproduction pendant la crise.<\/p>\n<p><strong>Depuis le 16 juin 2020, celui-ci est obtenu \u00e0 partir du nombre quotidien de tests PCR<\/strong> (tests effectu\u00e9s dans le nez) positifs. Avant cela, ce taux \u00e9tait calcul\u00e9 \u00e0 partir des passages aux urgences. Son calcul prend en compte plusieurs param\u00e8tres, dont le d\u00e9lai moyen d\u2019apparition d\u2019un nouveau cas contamin\u00e9 par une personne porteuse du virus (appel\u00e9 intervalle de g\u00e9n\u00e9ration).<\/p>\n<p>Un R inf\u00e9rieur \u00e0 1 refl\u00e8te une diminution du nombre de nouveaux cas (un porteur du virus contamine moins d\u2019une personne, il y a donc moins de cas \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration suivante) alors qu\u2019un R sup\u00e9rieur \u00e0 1 traduit une tendance \u00e0 l\u2019augmentation du nombre de cas (un porteur du virus contamine plus d\u2019une personne, il y a donc plus de cas \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration suivante).<\/p>\n<p><u>Conclusion:<\/u><\/p>\n<p>Il semblerait donc, qu\u2019au-del\u00e0 de la complexit\u00e9 qu\u2019implique le calcul du R0 r\u00e9el d\u2019un micro-organisme donn\u00e9, <strong>l\u2019estimation actuelle transmise par nos autorit\u00e9s sanitaires se baserait sur l\u2019\u00e9volution du nombre quotidien de tests PCR positifs<\/strong>\u2026 Inutile de rappeler l&rsquo;influence de la mont\u00e9e en puissance de la<strong> campagne de d\u00e9pistage de masse<\/strong>, ni l&rsquo;\u00e9ventualit\u00e9 de <strong>recenser des patients gu\u00e9ris anciennement infect\u00e9s<\/strong>.<\/p>\n<p>Puisque le pr\u00e9sident Macron exhorte (enfin) \u00e0 un d\u00e9pistage de masse et encourage (tous) les fran\u00e7ais \u00e0 aller se faire tester m\u00eame en l\u2019absence de sympt\u00f4mes, <strong>il y a fort \u00e0 parier que le R0 va continuer \u00e0 augmenter<\/strong> (artificiellement\u00a0?) dans les semaines \u00e0 venir\u2026 Choisirunmedecin vous livre ainsi un scoop avant qu\u2019il fasse les gros titres de vos journaux\u00a0!<\/p>\n<p>De plus, les m\u00e9thodes de calcul du R0 ont donc \u00e9t\u00e9 modifi\u00e9es \u00e0 compter du 16 Juin 2020. La raison de ce changement n&rsquo;est pas mentionn\u00e9e. Impossible de mettre en corr\u00e9lation directe les chiffres calcul\u00e9s avant le 16 Juin et apr\u00e8s cette date. <em>Don&rsquo;t act.<\/em><\/p>\n<p>Vous l\u2019aurez compris, l\u00e0 encore, il sera bien compliqu\u00e9 d\u2019interpr\u00e9ter de fa\u00e7on fiable cet indicateur d\u00e9voy\u00e9 pour l\u2019occasion\u2026<\/p>\n<p>Au fait, quid des d\u00e9c\u00e8s et autres nombres de patients hospitalis\u00e9s en r\u00e9animation\u00a0? Ces indicateurs n\u2019ont d\u00e9finitivement plus la c\u00f4te\u2026<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/07\/Capture-d\u2019\u00e9cran-2020-07-14-\u00e0-18.32.16.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-2874 aligncenter\" src=\"http:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/07\/Capture-d\u2019\u00e9cran-2020-07-14-\u00e0-18.32.16.png\" alt=\"\" width=\"736\" height=\"485\" \/><\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Sources: <a href=\"https:\/\/www.worldometers.info\/coronavirus\/country\/france\/\">Worldometers.info<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>En\u00a0\u00e9pid\u00e9miologie, le\u00a0nombre de reproduction de base\u00a0ou\u00a0R0\u00a0(ratio\u00a00) d&rsquo;une\u00a0infection\u00a0peut \u00eatre consid\u00e9r\u00e9 comme le nombre attendu de cas directement g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par un cas dans une population o\u00f9 tous les individus sont sensibles \u00e0 l&rsquo;infection. \u00ab\u00a0Le R0\u00a0[est] le nombre moyen de personnes qu\u2019une personne contagieuse peut infecter. Ce taux s\u2019applique, et se calcule \u00e0<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":2873,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[180,166,165,182,172,176,179,181,65],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2870"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2870"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2870\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2890,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2870\/revisions\/2890"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media\/2873"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2870"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2870"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.choisirunmedecin.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2870"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}